Деятельность семинара в 2008 году

Январь

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук.
Ананько Е.А. (с.н.с., Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
«Разработка технологии реконструкции и компьютерного анализа генных сетей и ее применение в биологических исследованиях»
Научный руководитель: чл.-корр. РАН, проф. Колчанов Н.А. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н. Меркулова Т.И.( ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Савинкова Л.К.( ИЦиГ СО РАН)
Презентация

Научный доклад.
Иванисенко В.А. (к.б.н., Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
«Компьютерная система автоматической экстракции знаний о молекулярно-генетических взаимодействиях из текстов рефератов PubMed и их представления в виде ассоциативных семантических сетей».

Февраль

Утверждение темы докторской диссертации.
Мордвинов В.А. (к.б.н., зав. Сектором функциональной геномики, Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН).
«Структурно-функциональная организация регуляторных районов и механизмы транскрипции генов интерлейкина-5 человека и мыши.»

Утверждение темы кандидатской диссертации
Прохорович М.А. (аспирант, Лаборатория морфологии и функции клеточных структур, ИЦиГ СО РАН).
» Хромосомные аномалии в эмбриональных стволовых клетках человека hESM01-04″
Научный руководитель: д.б.н. Рубцов Н.Б. (ИЦиГ СО РАН)

Утверждение темы докторской диссертации
Лихошвай В.А. (к.б.н., в.н.с., Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
«Математическое моделирование и компьютерный анализ генных сетей».

Апрель

Представление диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук.
Лихошвай В.А. (к.б.н., в.н.с., Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
«Математическое моделирование и компьютерный анализ генных сетей»
Научный консультант: чл.-кор. РАН, д.б.н, проф. Колчанов Н.А.
Рецензенты: д.б.н.,проф. Омельянчук Леонд Владимирович (ИЦиГ СО РАН), д.х.н., проф. Невинский Георгий Александрович (ИХБиФМ, ИЦиГ СО РАН) и д.ф.-м.н., проф. Фадеев Станислав Иванович (ИМ СО РАН)
Презентация

Утверждение тем кандидатских диссертаций по итогам отчетной сессии аспирантов ИЦиГ СО РАН.
Дементьева Е.В. (Лаборатория эпигенетики развития)
«Статус экспрессии генов и модификация хроматина на активной и неактивной Х-хромосоме у обыкновенных полевок»
Научный руководитель: д.б.н. Закиян С.М.

Медведев С.П. (Лаборатория эпигенетики развития)
«Структура, регуляция и экспрессия генов Oct4 и Nanog у обыкновенных полевок рода Microtus (Arvicolinae, Rodentia)»
Научный руководитель: д.б.н. Закиян С.М.

Нестеренко А.И. (Лаборатория цитогенетики животных)
«Сравнительная цитогенетика основных таксонов в отрядах Perissodactyla и Cetartiodactyla (Laurasiatheria, Mammalia)»
Научный руководитель: д.б.н., проф. Графодатский А.С.

Акбердин И.Р. (Сектор молекулярной эволюции, Лаборатория теоретической генетики)
«Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana«.
Научный руководитель: к.б.н. Лихошвай В.А.

Миронова В.В. (Лаборатория теоретической генетики)
«Компьютерный анализ генетических механизмов регуляции ауксином морфогенеза корня растения».
Научный руководитель: д.б.н. , чл-корр РАН Колчанов Н.А.

Тимонов В.С. (Лаборатория теоретической генетики)
«Методы и программные средства унифицированного доступа и визуализации биологических данных».
Научный руководитель: д.б.н., чл-корр РАН, Колчанов Н.А.

Утверждение темы кандидатской диссертации.
Брызгалов Л.О. (м.н.с., Лаборатория регуляции экспрессии генов, ИЦиГ СО РАН)
«Выявление связанных с регуляцией пролиферации генов-мишеней транскрипционных факторов FOXA» Научный руководитель: д.б.н., проф. Меркулова Т.И. (ИЦиГ СО РАН )

Утверждение темы кандидатской диссертации.
Николаев С.В. (н.с., Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
«Моделирование регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега Arabidopsis thaliana«
Научный руководитель: д.б.н., чл.-корр. РАН Колчанов Н.А. (ИЦиГ СО РАН)

Май

Утверждение темы докторской диссертации.
Иванисенко В.А. (к.б.н, с.н.с, Лаборатория теоретической генетики ИЦиГ СО РАН)
«Компьютерная реконструкция и анализ молекулярно-генетических взаимодействий в генных сетях»

Утверждение темы кандидатской диссертации.
Роцкая У.Н. (м.н.с., Лаборатория структуры генома, ИЦиГ СО РАН)
«Молекулярные механизмы соматического мутагенеза митохондриальной ДНК у крыс линий OXYS и Wistar»
Научный руководитель: к.б.н. Синицына О.И. (ИЦиГ СО РАН)

Утверждение темы кандидатской диссертации
Бухарина Т.А. (м.н.с., Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
«Реконструкция и анализ генной сети, контролирующей морфогенез механорецепторов у Drosophila melanogaster«.
Научный руководитель: д.б.н. Фурман Д.П. (ИЦиГ СО РАН)

Утверждение темы кандидатской диссертации
Шеховцов С.В. (аспирант, Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
«Исследование генетического разнообразия эпидемиологически значимых видов описторхид: Opisthorchis felineus, Opisthorchis viverrini, Clonorchis sinensis и Metorchis bilis« Научный руководитель: д.б.н., чл.-корр. РАН Колчанов Н.А. (ИЦиГ СО РАН)

Утверждение темы докторской диссертации
Пономаренко М.П. (к.б.н., с.н.с., Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
«Генетический текст: компьютерный анализ структурной и функциональной организации ДНК, РНК и белков»

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук.
Тетерина В.И. (м.н.с., Лаборатория биологии рыб и водных млекопитающих, ЛИН СО РАН)
«Исследование генетического разнообразия и процессов видообразования эндемичного семейства рыб озера Байкал — голомянок (Comephoridae) «
Научный руководитель: к. б. н. Кирильчик С.В. (ЛИН СО РАН)
Рецензенты: д.б.н. Бородин П.М. ( ИЦиГ СО РАН ) и к.б.н. Гунбин К.В. (ИЦиГ СО РАН)
Презентация

Июнь

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук.
Пахарукова М.Ю. ( м.н.с., Лаборатория регуляции экспрессии генов, ИЦиГ СО РАН)
«Изучение роли транскрипционных факторов HNF3 и ядерных рецепторов в механизме видовой специфичности действия гепатоканцерогенных азокрасителей»
Научный руководитель: д.б.н. Меркулова Т.И. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н. Гришанова А.Ю. (НИИ МББ СО РАМН) и к.б.н. Логвиненко Н.С. (ИЦиГ СО РАН)
Презентация

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук.
Прохорович М.А. (аспирант, Лаборатория морфологии и функции клеточных структур ИЦиГ СО РАН)
» Хромосомные аномалии в эмбриональных стволовых клетках человека hESM01-04″
Научный руководитель: д.б.н. Рубцов Н.Б. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: к.б.н. Мордвинов В.А. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Матвеева Н.М. (ИЦиГ СО РАН)
Презентация

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук.
Акбердин И.Р. (аспирант, Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
Отчет о диссертационной работе по окончании аспирантуры.
«Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana«
Научный руководитель: к.б.н. Лихошвай В.А. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н. Ефимов В.М. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Кочетов А.В.(ИЦиГ СО РАН)
Презентация

Отчет о диссертационной работе по окончании аспирантуры.
Шеховцов С.В. (аспирант, Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
«Исследование генетического разнообразия эпидемиологически значимых видов описторхид: Opisthorchis felineus, Opisthorchis viverrini, Clonorchis sinensis и Metorchis bilis«
Научный руководитель: академик РАН, д.б.н. Колчанов Н.А. (ИЦиГ СО РАН) Рецензенты: к.б.н. Блинов А.Г. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Юдин Н.С. (ИЦиГ СО РАН)

Июль

Утверждение темы кандидатской диссертации
Федорова Е.В. (н.с. лаборатории эволюционной биологии клетки, ИЦиГ СО РАН)
«Получение и анализ мутаций, затрагивающих интрон 2 гена Tritorax-like Drosophila melanogaster«.

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук.
Юдина О.С. (м.н.с., Лаборатория генетики клеточного цикла, ИЦиГ СО РАН)
«Изучение клеточных функций супрессора опухолей MERLIN на модели сперматогенеза Drosophila melanogaster«.
Научный руководитель: д.б.н. Омельянчук Л.В. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н. Демаков С.А. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Баричева Э.М.(ИЦиГ СО РАН)

Сентябрь

Научный доклад
Мазин А.В. (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Drexel University
College of Medicine, Philadelphia, PA, USA)
«РОЛЬ МИГРАЦИИ НИТЕЙ ДНК В ГОМОЛОГИЧНОЙ РЕКОМБИНАЦИИ»

Представление диссертационной работы по окончании аспирантуры
Яркова Е.Э. (аспирант, Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
«Реконструкция и компьютерный анализ ассоциативных сетей молекулярно-генетических взаимодействий»
Научный руководитель: д.б.н., академик РАН, Колчанов Н.А. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: к.б.н. Кочетов А.В. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Афонников Д.А. (ИЦиГ СО РАН)

Октябрь

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук.
Медведев С. П. (м.н.с., Лаборатория эпигенетики развития, ИЦиГ СО РАН)
«Структура, регуляция и экспрессия генов Oct4 и Nanog у обыкновенных полевок рода Microtus (Arvicolinae, Rodentia)»
Научный руководитель: д.б.н. Закиян С.М. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н. Таранин А.В. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Ромащенко А.Г. (ИЦиГ СО РАН)

Представление диссертационной работы по окончании аспирантуры.
Миронова В.В. (аспирант, Лаборатория теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН)
«Компьютерное исследование генетических механизмов регуляции ауксином развития корня растений».
Научный руководитель: к.б.н. Лихошвай В.А. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: к.б.н. Пономаренко М.П. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Ибрагимова С.С. (ИЦиГ СО РАН)

Утверждение темы кандидатской диссертации
Володько Н.В. (н.с., Лаборатория молекулярной генетики человека, ИЦиГ СО РАН)
«Анализ изменчивости митохондриальных ДНК юкагиров — коренных жителей Полярной Сибири».
Научный руководитель: проф., д.б.н. Сукерник Р.И. (ИЦиГ СО РАН )

Научный доклад
Посух О.Л. (к.б.н., с.н.с., Лаб. рекомбинационнного и сегрегационного анализа, ИЦиГ СО РАН)
«НАСЛЕДСТВЕННАЯ ГЛУХОТА: ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕХАНИЗМЫ, ПРОБЛЕМЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИАГНОСТИКИ, СОЦИАЛЬНЫЕ АСПЕКТЫ»

Информационное сообщение по итогам работы международного совещания
Захаренко Л.П. (к.б.н., с.н.с., Лаб. генетики популяций, ИЦиГ СО РАН)
«12th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles» September 23-26 2008 (Marseilles, France)

Ноябрь

Выборы кандидатов в члены Ученого совета ИЦиГ СО РАН

Утверждение рекомендации по представлению кандидатской диссертации Володько Н.В. (н.с., Лаборатория молекулярной генетики человека, ИЦиГ СО РАН) в защитный совет ИЦиГ.
«Анализ изменчивости мтДНК юкагиров и роль естественного отбора при заселении полярных районов Сибири»
Научный руководитель: д.б.н, проф. Сукерник Р. И. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., академик РАН Жимулев И. Ф. (ИЦиГ СО РАН), к.б.н. Бабенко В. Н. (ИЦиГ СО РАН)
Доклад был сделан 24 октября 2008 г. (Протокол №18), тема утверждена Ученым советом ИЦиГ 01.11.08.

Декабрь

Утверждение темы диссертации на соискание ученой степени доктора медицинских наук.
к.м.н. Фурсова А. Ж. (н.с. Сектора геномной и постгеномной фармакологии, ИЦиГ СО РАН)
«Патогенез возрастной макулодистрофии. Экспериментальное исследование»
Научный консультант: д.б.н. Колосова Н. Г. (зав. Сектором геномной и постгеномной фармакологии ИЦиГ СО РАН)

Утверждение темы кандидатской диссертации
Глушков С. А. (аспирант ИЦиГ СО РАН)
«Определение активностей ДНК-полимераз методами флуоресцентной детекции»
Научный руководитель: д.б.н. Дымшиц Г. М. (зав. Лаборатории структуры генома ИЦиГ СО РАН)

Информационное сообщение по итогам работы конференции «Хромосомная эволюция», состоявшейся в Санкт-Петербурге 26-27 ноября 2008 г.
д.б.н. Рубцов Н.Б. (ИЦиГ СО РАН)
д.б.н. Бородин П.М. (ИЦиГ СО РАН)