Вавиловский журнал генетики и селекции. 2012; Т.16, №4/1, с. 830-837. [полный текст]

Разработка пространственно распределенной модели эволюции прокариотических сообществ

Лашин C. А., Мамонтова Е.А., Матушкин Ю. Г.

Учреждение Российской академии наук Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, Новосибирск 630090

Новосибирский государственный университет, кафедра информационной биологии, Новосибирск 630090

e-mail: lashin[_at_]bionet.nsc.ru

Аннотация

В статье описаны методика моделирования функционирования и эволюции прокариотических сообществ и программный комплекс «Гаплоидный эволюционный конструктор» (http://evol-constructor.bionet.nsc.ru) для построения моделей с пространственным распределением по одной координате (1D). Приведено сравнение 0D (с полным перемешиванием) и 1D моделей прокариотического сообщества вида «отравитель–жертва». Показано влияние пространственного распределения субстратов и прокариотических клеток на стабильность сообщества.

Ключевые слова: Моделирование эволюции, микробное сообщество, пространственное распределение.

Библиографическая ссылка: Лашин C. А., Мамонтова Е.А., Матушкин Ю. Г. Разработка пространственно распределённой модели эволюции прокариотических сообществ // Вавиловский журнал генетики и селекции, 2012, т.16, №4/1, с. 830-837.