Рубрика: Публикации

Bacteriophages affect evolution of bacterial communities in spatially distributed habitats: a simulation study

BMC Microbiology. 2015; Т.15. № Suppl 1. С. S3 [полный текст] Bacteriophages affect evolution of bacterial communities in spatially distributed habitats: a simulation study Klimenko A.I., Matushkin Yu.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A. Department of Systems Biology, Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Novosibirsk, Russia; Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia, e-mail: klimenko[_at_]bionet.nsc.ru Аннотация Background Bacteriophages […]

Современные подходы к математическому и компьютерному моделированию в микробиологии

Вавиловский журнал генетики и селекции (ВЖГиС). 2015; Т.19. № 6. С. 745-752 [полный текст] Современные подходы к математическому и компьютерному моделированию в микробиологии Клименко А.И., Мустафин З.С., Чеканцев А.Д., Зудин Р.К. Матушкин Ю.Г., Лашин С.А. Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия Федеральное […]

Modeling evolution of spatially distributed bacterial communities: a simulation with the Haploid Evolutionary Constructor

BMC Evolutionary Biology. 2015; Т.15. № Suppl 1. С. S3 [полный текст] Modeling evolution of spatially distributed bacterial communities: a simulation with the Haploid Evolutionary Constructor Klimenko A.I., Matushkin Yu.G., Kolchanov N.A., Lashin S.A. Department of Systems Biology, Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Novosibirsk, Russia; Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia, e-mail: klimenko[_at_]bionet.nsc.ru Аннотация […]

HEC 2.0: improved simulation of the evolution of prokaryotic communities

Mathematical Biology and Bioinformatics. 2014; Т.9. № 2. С. 585-596 [полный текст] HEC 2.0: improved simulation of the evolution of prokaryotic communities Lashin S.A., Klimenko A.I., Mustafin Z.S., Kolchanov N.A., Matushkin Yu.G. Department of Systems Biology, Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Novosibirsk, Russia; Faculty of Natural Science, Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia, e-mail: […]

Разработка пространственно распределенной модели эволюции прокариотических сообществ

Вавиловский журнал генетики и селекции. 2012; Т.16, №4/1, с. 830-837. [полный текст] Разработка пространственно распределенной модели эволюции прокариотических сообществ Лашин C. А., Мамонтова Е.А., Матушкин Ю. Г. Учреждение Российской академии наук Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, Новосибирск 630090 Новосибирский государственный университет, кафедра информационной биологии, Новосибирск 630090 e-mail: lashin[_at_]bionet.nsc.ru Аннотация В статье описаны методика […]

Evolution, Biodiversity and Ecology in Microbial Communities: Mathematical Modeling and Simulation with the “Haploid Evolutionary Constructor” Software Tool

Sergey A. Lashin, Yury G. Matushkin, Alexandra I. Klimenko, Valentin V. Suslov and Nikolay A. Kolchanov (2014). Evolution, Biodiversity and Ecology in Microbial Communities: Mathematical Modeling and Simulation with the “Haploid Evolutionary Constructor” Software Tool, Biodiversity — The Dynamic Balance of the Planet, PhD. Oscar Grillo (Ed.), ISBN: 978-953-51-1315-7, InTech, DOI: 10.5772/58302. Available from: Evolution, […]

Теории биологической эволюции с позиции современного развития системной биологии

Генетика. 2012; Т.48. №. 5. с. 573-589 [полный текст] Теории биологической эволюции с позиции современного  развития системной биологии Лашин C. А., Суслов В. В., Матушкин Ю. Г. Учреждение Российской академии наук Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, Новосибирск 630090 Новосибирский государственный университет, кафедра информационной биологии, Новосибирск 630090 e-mail: lashin[_at_]bionet.nsc.ru Аннотация В работе проводится обзор […]

Haploid evolutionary constructor: new features and further challenges

In Silico Biology. 2011/2012; Т.11. № 3. С. 125-135 [полный текст] Haploid evolutionary constructor: new features and further challenges Lashin S.A., Matushkin Yu.G. Department of Systems Biology, Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Novosibirsk, Russia; Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia, e-mail: lashin[_at_]bionet.nsc.ru Аннотация In this paper we consider the recent advances in methodology for […]

Computer modeling of genome complexity variation trends in prokaryotic communities under varying habitat conditions

Ecological modelling. 2012; 224(1): 124-129 [full text] Computer modeling of genome complexity variation trends in prokaryotic communities under varying habitat conditions Lashin S.A., Matushkin Yu.G., Suslov V.V., Kolchanov N.A. Department of Systems Biology, Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Novosibirsk, Russia; Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia, e-mail: lashin[_at_]bionet.nsc.ru Abstract There are two types of […]

Эволюционные тренды в системах “прокариотическое сообщество” и “прокариотическое сообщество–фаг”

Генетика. 2011; 47(12): 1676-1685 [полный текст] Эволюционные тренды в системах “прокариотическое сообщество” и “прокариотическое сообщество–фаг” Лашин С.А., Матушкин Ю.Г., Суслов В.В., Колчанов Н.А. Учреждение Российской академии наук Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН; Новосибирский государственный университет, кафедра информационной биологии, Новосибирск 630090 e-mail: lashin[_at_]bionet.nsc.ru Аннотация В работе проводится компьютерное моделирование жизни и эволюции сообществ одноклеточных […]