Рубрика: Программа

Выпущен ГЭК v.2.0

Выпущена новая версия Гаплоидного Эволюционного Конструктора. Вы можете скачать её здесь. Версия ГЭК v.2.0 предоставляет графический интерфейс пользователя, параллельную версию вычислительного ядра, а также поддержку плагинов для модулей пользователя. В настоящий момент пользователь может создавать собственные плагины для описания изменения численности бактериальной популяции (т.н. трофические стратегии) и для описания внутриклеточного метаболизма (т.н. стратегии синтеза – […]

Выпущен ГЭК v.1.0.2

Выпущена новая версия Гаплоидного Эволюционного Конструктора. Вы можете скачать её  здесь. Текущая версия предоставляет графический пользовательский интерфейс, возможность использовать и сохранять скрипты, а также подключать пользовательские плагины трофических стратегий и стратегий синтеза. Программа доступна на платформах Windows и Linux. Системные требования:  Java(JRE) 1.6 или выше. Подробное описание языка моделирования ГЭК можно найти здесь. Здесь вы […]

Разработка плагинов ГЭК

Открытое API ГЭК В ГЭК существуют два типа плагинов: плагины трофических стратегий и плагины стратегий синтеза. Плагины необходимо собрать как динамические библиотеки (*.dll под Windows, *.so под Linux). Чтобы создать собственные плагины, нужно разработать подклассы абстрактных классов Increaser (для трофических стратегий) и SynthesisStrategy (для стратегий синтеза). Реализация новой трофической стратегии Класс Increaser содержится в файле […]

Using special script language for HEC models

Instruction to Evolutionary Constructor script language The software package “Evolutionary constructor” (EC) provides modeling scenarios with the use of the special script language. Any scenario of EC model consists of two consequent sections: 1) Model declaration section; 2) Calculation section. The comment lines may begin with the following symbols: // (C-style), ! (Fortran-style), and % […]

EC v.1.0.1 is released

The beta-version of EC v.1.0.1 is released and ready to download. The current version is only script-based, no GUI provided. The detailed description of the script modelling language of EC is here. The description of files generated with EC modelling process is here.