База данных «Тимус крыс-самок Wistar и его взаимосвязь с содержанием микроРНК в лимфе и сыворотке крови при лечении химически индуцированного рака молочной железы у крыс-самок Wistar (ТРМЖ)»

Разработчик

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Казаков О.В., Кабаков А.В., Повещенко А.Ф., Черкас В.Н.

Краткая характеристика

База данных «ТРМЖ» содержит информацию о взаимосвязи структурных преобразований в тимусе (вилочковой железе) с содержанием проонкогенных miR (-21, -221, -222) и опухоль-супрессирующей miR-429 в лимфе грудного протока и сыворотке крови крыс-самок Wistar при химически индуцированном канцерогенезе (N-метил-N-нитрозомочевина) в область правой 2-й молочной железы, а также после лечения РМЖ через 6 месяцев после инициации роста опухоли: химиотерапии (по схеме ЦМФ), оперативного лечения и химиотерапии (по схеме ЦМФ), оперативного лечения, химиотерапии (по схеме ЦМФ) и введения в лечение фрагментированной ДНК человека.

По инструкции производителя концентрацию микроРНК в лимфе грудного лимфатического протока оценивали методом выделения из лимфы тотальной РНК с использованием набора реагентов «Вектор-Бест». Для получения кДНК проводили обратную транскрипцию (ОТ) по матрице микроРНК. Для определения уровней микроРНК в биологических образцах выполняли ОТ-ПЦР в реальном времени на амплификаторе CFX96 (Bio-Rad Lab), в качестве гена сравнения использовали малую РНК U6 («Вектор-Бест»).

Области возможного использования

База данных «ТРМЖ» предназначена для применения, как в области фундаментальных исследований, так и в комплексном подходе при разработке новых методов лечения рака молочной железы, оценке действия известных и новых противоопухолевых цитостатических препаратов. В базу данных включены количественные данные проонкогенных miR (-21, -221, -222) и опухоль-супрессирующей miR-429 в лимфе и сыворотке крови, и их взаимосвязи с данными морфометрии структурных зон тимуса (субкапсулярная зона коркового вещества, центральная часть коркового вещества, кортико-медуллярная зона, центральная часть мозгового вещества): при РМЖ; после оперативного лечения РМЖ; после химиотерапии РМЖ; после оперативного лечения и химиотерапии РМЖ; после оперативного лечения, химиотерапии РМЖ и введения фрагментированной ДНК человека.

Степень готовности разработки к практическому применению

База данных готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Выявленные взаимосвязи преобразований в структурных зонах тимуса (субкапсулярная зона коркового вещества, центральная часть коркового вещества, кортико-медуллярная зона, центральная часть мозгового вещества) с содержанием проонкогенных miR (-21, -221, -222) и опухоль-супрессирующей miR-429 в лимфе грудного протока и сыворотке крови могут позволить исследовать участие микроРНК в регуляции иммунного ответа, воздействии на процессы созревания, пролиферации, дифференцировки и активации клеток иммунной системы, что важно для понимания прогрессирования опухолевого процесса и при его лечении.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Представленная база данных «ТРМЖ» уникальна, поскольку в существующих базах данных нет информации об исследовании взаимосвязи содержания микроРНК в лимфе и сыворотке крови с данными морфометрии структурных зон тимуса (субкапсулярная зона коркового вещества, центральная часть коркового вещества, кортико-медуллярная зона, центральная часть мозгового вещества) в нормальных условиях жизнедеятельности и при патологических состояниях. База данных «ТРМЖ» содержит информацию по исследованию взаимосвязи преобразований в структурных зонах тимуса (субкапсулярная зона коркового вещества, центральная часть коркового вещества, кортико-медуллярная зона, центральная часть мозгового вещества) с содержанием микроРНК в лимфе грудного протока и крови в физиологических условиях жизнедеятельности организма и после введения химического вещества для индукции злокачественной опухоли молочной железы, соответствующей люминальному В типу рака молочной железы человека и после его лечения.

В существующих базах данных нет информации о содержании микроРНК в лимфе.

Защита разработки

Свидетельство о регистрации № 2024623223, зарегистрирована в Реестре баз данных 19.07.2024г., Заявка № 2024622976, дата поступления заявки: 10.07.2024г.