Разработчик

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Чадаева И.В., Ершов Н.И., Подколодный Н.Л., Кожемякина Р.В., Рассказов Д.А., Богомолов А.Г., Кондратюк Е.Ю., Шихевич С.Г., Рязанова М.А., Федосеева Л.А., Редина О.Е., Кожевникова О.С., Стефанова Н.А., Колосова Н.Г., Маркель А.Л., Пономаренко М.П., Ощепков Д.Ю.

Краткая характеристика

База данных (БД) предназначена для хранения информации о дифференциально экспрессирующихся генах (ДЭГ) крысы и человека и представляет собой коллекцию опубликованных данных по экспрессии генов у крыс разных линий, предназначенных для изучения различных заболеваний. БД содержит 25101 ДЭГ, представляющих 14320 уникальных генов крысы, которые изменяют уровень транскрипции в 21 ткани 10 генетических линий крысы в качестве моделей 11 заболеваний человека согласно 44 оригинальным научным статьям.

Структура базы данных дифференциально экспрессирующихся генов крыс как модельных объектов заболеваний человека (RatDEGdb)

Пример записи в базе знаний RatDEGdb, в которой представлены оригинальные экспериментальные данные об уровнях экспрессии генов лабораторных линий крыс в качестве биомедицинских моделей заболеваний человека вместе с их аннотацией с использованием независимых данных об уровнях экспрессии генов человека у больных.

Области возможного использования

База данных может быть использована в первую очередь специалистами по генетике человека, молекулярными биологами, клиницистами и генетическими консультантами, а также специалистами в области биофармацевтики, биоинформатики и персонализированной геномики.

Степень готовности разработки к практическому применению

БД готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Технический эффект использования базы данных заключается в полностью готовой платформе для дальнейших исследований в области моделирования с применением животных заболеваний человека. Возможный экономический эффект использования базы данных выражается в снижении денежных затрат на исследования в области фармакологии и персонализированной медицины.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Базы данных с курируемым наполнением содержания, с аналогичной структурой и набором информационных полей в настоящее время отсутствуют.

Защита разработки

Свидетельство о госрегистрации № 2023623888, дата регистрации 10.11.2023.