Набор ДНК-маркеров для отбора ячменя с повышенным содержанием антоцианов в перикарпе зерновки

Патентообладатели

ИЦиГ СО РАН

Авторы
Шоева О.Ю., Кукоева Т.В., Хлесткина Е.К.

Краткая характеристика

Предложен набор ДНК-маркеров для отбора гибридов ячменя с повышенным содержанием антоцианов в перикарпе зерновки, синтез которых контролируется генами Ant1 и Ant2. Предлагаемый набор содержит ДНК маркеры Ant1.F1/Ant1.R1, Ant2.F1/Ant2.R1 и Ant2.F2/Ant2.R2, имеющие следующие нуклеотидные последовательности Ant 1.F1: 5′-GCGGCTTGATTTGTTTCАТА-3′, Ant1.R1: 5′-TTTAAATGGCGAGGTAAGGT-3′, Ant2.F 1: 5′-GCTGGAACACACGTACAAGA-3′, Ant2.R1: 5′-CTTTGAGCTATGGAGACC AAGAA-3′, Ant2.F2: 5′-CATTCATGTCGGTCCAGAAC-3′, Ant2.R2: 5′-CAGAGGAACTGCTTCGTTAAA-3′.


Cтруктурная организация гена Ant1 и места отжига разработанного маркера Ant1.F1/Ant1.Rl(SEQ ID NO 1, 2), которые фланкируют районы локализации инсерций/делеций, выявленных в 5′-некодирующем районе гена Ant1 с помощью сравнения аллелей этого гена, найденных в базе данных пангеномных последовательностей ячменя.
Cтруктурная организация гена Ant2 и места отжига ДНК-маркеров Ant2.F1/Ant2.R1 (SEQ ID NO 3, 4), фланкирующие район локализации инсерций/делеций, выявленных на основе сравнения аллелей гена Ant2 из базы данных пангеномных последовательностей ячменя с уникальным аллелем гена Ant2, характерным для фиолетовозерных образцов ячменя.

Области возможного использования

Изобретение относится к сельскому хозяйству и биотехнологии и может быть использовано в генетике и селекции ячменя.

Степень готовности разработки к практическому применению

Разработка готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Использование предлагаемых ДНК-маркеров позволит существенно расширить функциональные возможности способа, снизить трудозатраты, повысить точность и скорость отбора фиолетовозерных образцов ячменя.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Основным недостатком известного ранее набора ДНК-маркеров является его ограниченная функциональная возможность, связанная с тем, что ДНК-маркеры были разработаны для выявления аллелей генов Ant1 и Ant2 непосредственно у сорта «Bowman» и линии PLP и их использование для отбора фиолетовозерных образцов ограничено лишь гибридными комбинациями сортов, отличающихся наличием описанных делеций в генах Ant1 и Ant2. Разработанный набор ДНК-маркеров может быть применен для отбора гибридов ячменя с повышенным содержанием антоцианов в перикарпе зерновки на основе как белозерных красностебельных, так и белозерных сортов/линий ячменя, не имеющих антоциановой окраски стебля и основания растения.

 

Патентная защита разработки

Патент № 2797678, опубл. 07.06.2023 , Бюл. № 16.