Патентообладатель: ФГБНУ «ФИЦ ИЦиГ СО РАН»

Авторы: Мухин А.М., Лахова Т.Н., Клименко А.И., Казанцев Ф.В., Деменков П.С., Лашин С.А.

Краткая характеристика:

База данных предназначена для хранения ключевой информации о штаммах бактерий, обладающих биотехнологическим потенциалом. База состоит из двух модулей: хранилища данных и модуль метаданных. Хранилище данных предоставляет доступ к геномным последовательностям, полученным в результате секвенирования, и информации, полученной в результате их биоинформатического анализа и обработки – результаты сборки геномов, аннотации геномов, метаболические пути, фреймовые математические модели метаболических путей. Модуль метаданных обеспечивает индексацию хранимых данных для быстрого поиска потенциально значимых штаммов бактерий для задач промышленной биотехнологии.

Схема программного решения

Области возможного использования:

База данных может быть использована в микробиологии и биотехнологии, например, для поиска штаммов бактерий определенного вида, для выявления в них общих и различающихся метаболических путей.

Степень готовности разработки к практическому применению:

База данных готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Основной экономический эффект от внедрения базы может быть связан с ускорением и автоматизацией процессов поиска биологически-значимых свойств для индивидуальных штаммов и выявления их интегративных характеристик.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Известные и используемые платформы по хранению комплексных данных о биологических объектах – openBIS (https://openbis.ch/) и SEEK (https://fair-dom.org/platform/seek/). Эти системы не имеют достаточной функциональности по поиску результатов биоинформатического анализа и математических моделей.

Защита разработки:

Свидетельство о регистрации № 2021621155, зарегистрирована в Реестре баз данных 31.05.2021 , Бюл. № 6, Заявка № 2021621025 , дата поступления заявки: 25.05.2021.