Базы данных «Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию микроэлементов»

Разработчик

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Злобин А.С., Потапова Н.А., Цепилов Я.А., Виниченко Н.А., Леонова И.Н., Салина Е.А.

Краткая характеристика

Базы данных (БД) содержат в себе информацию о коэффициентах оценки селекционной ценности по содержанию в пшенице Triticum aestivum микроэлементов (кальция, калия, меди, магния, марганца, железа, цинка), полученных для 12549 однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП), равномерно распределённых в геноме. Данные коэффициенты были получены методом BLUP на материале 157 различных сортов пшеницы. Для каждого ОНП доступна следующая информация: его уникальное название, коэффициент оценки сортовой ценности по содержанию микроэлемента, физическое положение в геноме (хромосома, позиция) и референсный аллель.

Области возможного использования

БД предназначены для применения в области маркер-ориентированной и геномной селекции российских сортов пшеницы Triticum aestivum и могу быть полезны для работников сельского хозяйства (например, агрономов, селекционеров, работников научных и учебных организаций, студентов)

Степень готовности разработки к практическому применению

Базы данных готовы к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

С помощью БД возможен отбор маркеров для селекции по увеличению содержания микроэлемента в пшенице. Это может способствовать увеличению прибыли фермерских хозяйств, которые выращивают и продают пшеницу.

Сравнительные характеристики с известными разработками

БД не имеют аналогов для российских сортов пшеницы.

Защита разработок

«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию кальция (КСЦКа) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by calcium content (СBVCa)» Свидетельство о регистрации № 2023621647, зарегистрирована в Реестре баз данных 23.05.2023.

«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию меди (КСЦМ) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by cuprum content (СBVCu)» Свидетельство о регистрации № 2023622284, зарегистрирована в Реестре баз данных 07.07.2023.

«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию калия (КСЦК) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by potassium content (СBVK)» Свидетельство о регистрации № 2023622285, зарегистрирована в Реестре баз данных 07.07.2023.

«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию железа (КСЦЖ) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by ferrum content (СBVFe)». Свидетельство о регистрации № 2023622283, зарегистрирована в Реестре баз данных 07.07.2023.

«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию магния (КСЦМг) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by magnesium content (СBVMg)». Свидетельство о регистрации № 2023622542, зарегистрирована в Реестре баз данных 25.07.2023.

«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию марганца (КСЦМн) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by manganese content (СBVMn)» Свидетельство о регистрации № 2023622543, зарегистрирована в Реестре баз данных 25.07.2023.

«Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности пшеницы по содержанию цинка (КСЦЦ) / Сoefficients of single nucleotide polymorphisms for evaluation the breeding value of wheat by zinc content (СBVZn)» Свидетельство о регистрации № 2023622544, зарегистрирована в Реестре баз данных 25.07.2023.