Разработчик

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Игнатьева Е.В. Михайлова А.Д., Лашин С.А., Иванов Р.А., Иванисенко В.А., Деменков П.С.

Краткая характеристика

База данных (БД) предназначена для хранения информации о генной сети, регулирующей биосинтез холестерина у человека и других видов животных. БД создана на основе сведений из базы «WikiPathways» и системы «ANDSystem». В БД содержатся данные о метаболитах, входящих в путь биосинтеза холестерина, белках и генах, регулирующих этот процесс, регуляторных связях между всеми этими объектами. В БД также содержатся данные о таких эволюционных характеристиках генов, как индекс филостратиграфического возраста (PAI) и индекс эволюционной изменчивости (DI).

Области возможного использования

База данных может быть использована:

• при создании математических моделей, предсказывающих динамику системы регуляции биосинтеза холестерина;
• при разработке более эффективных подходов персонализированной медицины на всех этапах, включая диагностику (выявление генов, несущих повреждающие мутации), выбор средств фармакологического воздействия, а также профилактику (генотипирование с целью оценки риска патологии);
• в процессе обучения студентов различных факультетов (биологов, математиков, информатиков), обучающихся  в бакалавриате и магистратуре

Степень готовности разработки к практическому применению

База данных готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Технический эффект использования базы данных «БиосХолНетГенЭвол»  заключается в том, что она представляет собой исследовательский инструмент, который позволяет осуществлять быстрый поиск формализованных и ситематизированных данных о системе регуляции биосинтеза холестерина в клетках человека: о генах, белках, метаболитах, имеющихся между ними регуляторных связях, а также об эволюционных характеристиках рассматриваемых генов (относительном эволюционном возрасте и генетической изменчивости). База данных имеет прикладную значимость при разработке более эффективных подходов персонализированной медицины на всех этапах, включая диагностику (выявление генов, несущих повреждающие мутации), выбор средств фармакологического воздействия, а также профилактику (генотипирование с целью оценки риска патологии).

Сравнительные характеристики с известными разработками

Является единственной известной авторам базой данных о генной сети регуляции биосинтеза холестерина у человека, включающей сведения  как о функционирующих в этой сети генах, белках, метаболитах, регуляторных связях, так и об относительном эволюционном возрасте рассматриваемых генов и их генетической изменчивости.

Защита разработки

Свидетельство о регистрации №2025623265 зарегистрирована в Реестре баз данных 07.08.2025, Бюл. № 8, дата поступления заявки: 2025622742 21.07.2025