Разработчик

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Шоева О.Ю., Тоцкий И.В. , Кукоева Т.В.

Краткая характеристика

Предложен CAPS-маркер для отбора гибридов ячменя, не содержащих проантоцианидины в зерне, синтез которых контролируется геном Hvmyb10. Маркер представляет собой олигонуклеотидные праймеры, имеющие нуклеотидные последовательности Ant28_F: 5’-TTGTGTGCAGGGCTGAATAG-3’ и Ant28_R: 5’-GAAACTCCAACGGAAGGGTTAG-3’, и эндонуклеазу рестрикции ApaLI, которая расщепляет полученный с помощью этих праймеров ПЦР-продукт доминантного аллеля гена Hvmyb10 длиной 414 пар нуклеотидов (п.н.) на два фрагмента длиной 141 и 273 п.н., в то время как рецессивный аллель остается нерасщепленным, что позволяет отобрать гомозиготные по рецессивному аллелю гена Hvmyb10 растения, не накапливающие проантоцианидины в зерне.

Структурная организация гена Hvmyb10 и локализация однонуклеотидных замен, выявленных в мутантных аллелях этого гена.

Области возможного использования

Изобретение относится к сельскому хозяйству и биотехнологии и может быть использовано в генетике и селекции ячменя.

Степень готовности разработки к практическому применению

Разработка готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Использование предлагаемого CAPS-маркера позволит повысить точность и скорость отбора гибридов ячменя, не содержащих проантоцианидины в зерне.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Наиболее близким к заявляемому маркеру является маркер dCAPS (derived Cleaved Amplified Polymorphic Sequences), разработанный для выявления мутантных аллелей гена Hvmyb10 у мутантов ant28.484, -493, -494, -495 (Himi E., Yamashita Y., Haruyama N., Yanagisawa T., Maekawa M., Taketa S. Ant28 gene for proanthocyanidin synthesis encoding the R2R3 MYB domain protein (Hvmyb10) highly affects grain dormancy in barley // Euphytica. 2012. V. 188. P. 141-151.). Недостатком известного dCAPS маркера является его ограниченная функциональная возможность, связанная с тем, что данный маркер может быть использован только для анализа гибридов ячменя, полученных в результате скрещивания сортов/линий ячменя, накапливающих проантоцианидины в зерне, и одного из беспроантоцианидиновых мутантов ant28.484, -493, -494, -495, имеющих в позиции 51 замену G/A.

Патентная защита разработки

Патент на изобретение №2804853.  Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений 11.12.2023. Номер и дата поступления заявки: 2023100714, 12.01.2023, Бюл. №35.