АВТОРЫ Ратушный А.В., Недосекина Е.А., Лашин С.А.

ХАРАКТЕРИСТИКА

База данных «ModelER» предназначена для накопления математических моделей, описывающих регуляцию ферментативных реакций, эффективность экспрессии генов, формирование белковых комплексов, трансдукцию сигналов и др. В базу могут вноситься математические моде-ли как с верифицированными, так и с оцененными структурой и параметрами. Верификация моделей производится с использованием количественных и качественных опубликованных экспериментальных данных. Единицей входа в базу является математическая модель определенного молекулярно-генетического процесса.

ТЕХНИКО-ЭКОНОМИЧЕСКИЕ ПРЕИМУЩЕСТВА

База данных содержит оригинальные и опубликованные математические модели кинетики более 300 ферментативных реакций Escherichia coli. По количеству кинетических моделей ферментативных реакций для определенного организма база данных не имеет аналогов в Российской Федерации и за рубежом

ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ

База данных «ModelER» может быть использована при построении математических моде-лей различных совокупностей внутриклеточных процессов (например, ферментативных реакций определенного метаболического пути), для исследования кинетики участвующих в исследуемой совокупности процессов молекулярных компонентов (в частности, для решения биотехнологически значимых задач).

УРОВЕНЬ ПРАКТИЧЕСКОЙ РЕАЛИЗАЦИИ

База данных реализована в виде флэт-файла. Планируется провести пополнение базы данных математическими моделями регуляции экспрессии генов, кодирующих белки ферментативных комплексов Escherichia coli. Также планируется реализация интернет-доступной версии базы данных.

ПАТЕНТНАЯ ЗАЩИТА

Получено свидетельство об официальной регистрации № 2006620196.

КОММЕРЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

Лицензионное соглашение.

ОРИЕНТИРОВОЧНАЯ СТОИМОСТЬ

Не рассчитывалась.

Email: lashin@bionet.nsc.ru