Патентообладатель: ФГБНУ «ФИЦ ИЦиГ СО РАН»

Авторы:

Деменков П.С., Иванисенко В.А.

Краткая характеристика:

Программа «ПроТаксон» предназначена для построения распределения таксонов для вновь секвенированных геномов прокариот. Программа осуществляет поиск гомологичных последовательностей по базе полных геномов прокариот с помощью алгоритмов Blast, выделяет фрагменты последовательностей, имеющие наибольший уровень сходства и строит  распределение встречаемости таксонов найденных фрагментов последовательностей для самых длинных скаффолдов, покрывающих 50% генома.

Области возможного использования:

Программа может быть использована в области генетики, молекулярной биологии, медицины и биотехнологии.

Степень готовности разработки к практическому применению:

Программа готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Улучшение качества аннотации вновь секвенированных геномов технологически значимых микроорганизмов.

Сравнительные характеристики с известными разработками

В отличие от классических методов таксономии по 16S РНК, программа «ПроТаксон» позволяет определить организм даже в случае отсутствия последовательности 16S в собранном геноме.

Защита разработки: Свидетельство о регистрации № 2021680242, зарегистрирована в Реестре ПрЭВМ 08.12.2021, номер и дата поступления заявки: 2021669520 от 29.11.2021.