База данных «Коэффициенты однонуклеотидных полиморфизмов для оценки селекционной ценности сои по массе 100 зерен (КСЦСМ100)»

Разработчик

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Свищёва Г.Р., Злобин А.С., Потапова Н.А., Зоркольцева И.В., Салина Е.А., Цепилов Я.А., Федяева А.В.

Краткая характеристика

База данных (БД) содержит информацию о коэффициентах оценки селекционной ценности по массе 100 зерен в сое Glycine max, полученных на импутированных данных, включающих 172 512 однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП), равномерно распределённых по всему геному. Данные коэффициенты были получены методом BLUP на материале 180 различных сортов сои. Для каждого ОНП доступна следующая информация: его уникальное название, коэффициент оценки сортовой ценности по массе 100 зерен, физическое положение в геноме (хромосома, позиция) и референсный аллель.

Области возможного использования

БД предназначена для применения в области маркер-ориентированной и геномной селекции российских сортов сои Glycine max. База данных может быть полезна для работников сельского хозяйства (например, агрономов, селекционеров, сотрудников научно-исследовательских и учебных организаций, студентов).

Степень готовности разработки к практическому применению

БД готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

С помощью БД возможен отбор маркеров для селекции по увеличению массы 100 зерен у сои. Это может способствовать увеличению прибыли фермерских хозяйств, которые выращивают и продают сою.

Сравнительные характеристики с известными разработками

БД не имеет аналогов для российских сортов сои.

Защита разработки

Свидетельство о госрегистрации № 2024624551, дата регистрации 18.10.2024.