Программа для ЭВМ «Программный комплекс для предсказания потенциально транслируемых открытых рамок считывания «AUGWeb»»

Патентообладатель

ФГБУН ИЦиГ СО РАН

Авторы

Лашин С.А., Кочетов А.В., Афонников Д. А., Зураев Б.С., Клименко А.И.

Краткая характеристика

Программа рассчитывает и выдает пользователю найденные открытые рамки считывания и аминокислотные последовательности (с указанием эффективности трансляции и используемого механизма) для заданной мРНК. Программа доступна в виде веб-приложения, а также отдельного java-приложения.

Области возможного использования

Программа «AUGWeb» может быть использована при проведении высокотехнологичных исследований в области геномики и протеомики, цель программы – выявление «скрытого» кодирующего потенциала уже известных эукариотических мРНК.

Степень готовности разработки к практическому применению

Программа «AUGWeb» готова к практическому применению

Возможный технический и (или) экономический эффект

Использование программы позволит расширить возможности планирования экспериментов с генами эукариот и выявлять новые биологически активные белки и пептиды.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Программа «AUGWeb» является единственной, известной авторам на сегодняшний день, программой предсказания потенциальных открытых рамок считывания, использующих следующие модели трансляции: линейного сканирования, реинициации трансляции и «подтекающего» сканирования (leaky scanning).

Патентная защита разработки

Свидетельство о регистрации № 2015662839 от 04.12.2015.