Разработчик

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Климонтов В.В., Шишин К.С., Мухин А.М., Лашин С.А.

Краткая характеристика

В базе данных GlucoGenes содержится информация о генах и белках, ассоциированных с нарушениями метаболизма глюкозы: гипогликемией, гипергликемией, повышенной вариабельностью глюкозы.
Данные были получены в ходе исследований по анализу генов, ассоциированных с нарушениями метаболизма глюкозы, с использованием биоинформатического анализа генных сетей и интеллектуального анализа текстов PubMed-индексированных публикаций с использованием инструментов ANDSystem.

Для управления доступом к базе данных использована технология REST. Графический интерфейс разработан с использованием Vue.js. База данных построена на основе системы управления базами данных PostgreSQL. База данных GlucoGenes  включает шесть ключевых таблиц, отражающих гены, кодируемые ими белки, патологии, типы ассоциаций, ссылки на литературные источники и сводные данные. На данный момент база данных содержит данные о 561 гене, связанном с нарушениями метаболизма глюкозы, и 2115 записях, описывающих эти связи.

Графический пользовательский интерфейс базы данных GlucoGenes
доступен по https://glucogenes.sysbio.ru/genes. Интерфейс базы данных
GlucoGenes содержит следующие функциональные разделы:

— главная страница: содержит общую информацию о GlucoGenes ;

— каталог генов, ассоциированных с диабетом: содержит информацию о наименовании гена, его описание, а также информацию о типе ассоциации с нарушениями метаболизма глюкозы;

— каталог белков, кодируемых генами: содержит информацию о белках, а также о типе ассоциации с нарушениями метаболизма глюкозы. Имеется возможность перейти по гиперссылке на предыдущий каталог и просмотреть соответствующую литературу по этому типу ассоциации;

— страница загрузок с возможностью выгрузить таблицы генов в формате Excel.

Области возможного использования

База данных может быть использована в научных исследованиях, посвященным молеклярно-генетическим механизмам регуляции обмена глюкозы у человека, а также генетике, этиологии, патогенезу сахарного диабета и его осложнений, и выявлению таргетных молекул для терапии.

Степень готовности разработки к практическому применению

База данных готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

База данных GlucoGenes представляет собой исследовательский инструмент, который позволяет осуществлять быстрый поиск информации о генах и их продуктах, ассоциированных с колебаниями уровня глюкозы, гипогликемией и гипергликемией, а также о характере связей между генами, продуктами и нарушениями метаболизма глюкозы.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Является единственной известной авторам базой данных о генах и их продуктах, ассоциированных с колебаниями уровня глюкозы, гипогликемией и гипергликемией, а также о характере связей между генами, продуктами и нарушениями метаболизма глюкозы.

Защита разработки

Свидетельство о регистрации № 2024620671 , зарегистрирована в Реестре баз данных 12.02.2024, Бюл. № 2. Номер и дата поступления заявки: 2024620152  16.01.2024.