Программа для ЭВМ «Оценка длины теломерных районов хромосом (МеТеЛен)»

Правообладатели

НИИФКИ, ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Богомолов А.Г., Барковкая М.Ш., Рубцов Н.Б.

Краткая характеристика

Программа позволяет анализировать 24-битные двуцветные Q-FISH изображения метафазных пластинок, а именно: проводить нормировку регистрируемого сигнала Q-FISH, устранять эффект неравномерного освещения и сдвиг суммируемых изображений относительно друг друга, полуавтоматически определять границы биологических объектов, вручную идентифицировать хромосомы и определять принадлежность к ним теломер, исключить фоновый сигнал из вычислений, сохранять результаты анализа в формате MS Excel (*.xlsx), строить профили интенсивности и гистограммы.


увеличить

Q-FISH изображение (ExpTime 5540)

Области возможного использования

Программа «МеТеЛен» предназначена для автоматизации анализа относительной и/или абсолютной длины теломер в отдельных p- и q-плечах индивидуальных хромосом человека и других видов млекопитающих по методу количественной флуоресцентной гибридизации in situ (Q-FISH).

Степень готовности разработки к практическому применению

Программа «МеТеЛен» готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Программа облегчает работу специалисту путем полуавтоматической обработки изображений.

Сравнительные характеристики с известными разработками

В известных аналогах отсутствуют функции аннотации хромосом и теломер, разделения и полуавтоматического удаления полученных масок хромосом и теломер, калибровка флуоресцентной интенсивности на изображении. Отличительной особенностью программы является реализация нескольких способов оценки уровня фонового сигнала и исправление неравномерного освещения изображения.

Патентная защита разработки

Свидетельство о регистрации № 2016614696, зарегистрирована в Реестре программ для ЭВМ 27.04.2016