Программа поиска вариабельности генов VRN1 у пшениц и эгилопсов (ВРН1-Вит-ЮИ)

Патентообладатель

ФГБНУ «ФИЦ ИЦиГ СО РАН»

Авторы

Вавилова В.Ю., Генаев М.А., Конопацкая И.Д., Гончаров Н.П.

Краткая характеристика

Программа «VRN1-Wheat-UI» является компьютерной технологией в области системной биологии растений. Программа имеет графический web интерфейс, который предоставляет пользователям возможность проводить поиск интересующих образцов, планировать эксперименты и обеспечивает хранение данных о различных экспериментах и образцах пшениц и эгилопсов.

Области возможного использования

Программа разработана для экспериментаторов-селекционеров и исследователей, которые заинтересованы в получении информации о генах VRN1 и их взаимосвязи с признаком яровость-озимость у различных видов пшениц и эгилопсов.

Степень готовности разработки к практическому применению

Программа «VRN1-Wheat-UI» готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Программа позволяет оптимизировать научно-исследовательский процесс в области молекулярно-биологических и генетических исследований растений. Использование программы позволит пользователю узнать полную информацию об интересующем его образце и эффективно провести запланированную экспериментальную работу.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Объединение и аннотация геномных последовательностей в базы данных и предоставление к ним доступа через web интерфейс является общепринятой практикой в биологии. Крупнейшая коллекция таких последовательностей – база данных NCBI GenBank https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/, в которой содержатся последовательности, полученные в результате различных молекулярно-генетических экспериментов. Существуют более специализированные базы данных, например, PlantProm (http://www.softberry.com/berry.phtml?topic=plantp_2016.03&subgroup=plantprom&group=data&no_menu=on) база данных промоторов у растений. Отличительной особенностью разработанной программы является интеграция геномных данных с данными о фенотипе растения и предоставление дополнительного инструментария для сравнения последовательностей, содержащихся в базе.

Патентная защита разработки

Свидетельство о госрегистрации  № 2017663114, дата регистрации 22.11.2017.