Патентообладатель

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Медведева И.В., Брагин А.О., Чадаева И.В., Маркель А.Л., Орлов Ю.Л.

Краткая характеристика

Разработанная база данных (БД) предназначена для хранения информации о транскриптах, дифференциально экспрессирующихся в отделах головного мозга у агрессивных и ручных крыс. БД «Maggene» содержит описательную информацию о транскрипте, кодирующем его гене и кодируемом белке, об уровнях экспрессии транскрипта, а также о взаимодействиях кодируемых белков между собой. Структура базы позволяет пополнять ее данными других экспериментов по изучению агрессии.

Веб-интерфейс базы данных Maggene для аннотации генов крысы, связанных с агрессивных поведением. Уровни экспрессии генов в отделах мозга крыс, селекционированных по поведению, получены с помощью технологии RNA-seq.

Области возможного использования

База данных «Maggene» предназначена для хранения информации о транскриптах, дифференциально экспрессирующихся в отделах головного мозга у агрессивных и ручных крыс.

Степень готовности разработки к практическому применению

База данных «Maggene» готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Структура базы позволяет пополнять ее данными других экспериментов по изучению агрессии, в том числе других видов. Данные, представленные в базе данных, могут использоваться в образовательных целях.

Сравнительные характеристики с известными разработками

В настоящий момент известен ряд генов, которые ассоциированы с агрессивным поведением у человека, животных и насекомых, однако эти данные не интегрированы в какую-либо базу данных. Известна база данных «KEGG», в которой представлены метаболические пути, в которых задействованы ряд известных генов, однако генной сети агрессивного поведения в данной базе нет. База данных «Maggene» содержит информацию как о генах, ассоциированных с агрессией на основе собственных экспериментов, так и о генах, известных из доступных источников информации.

Защита разработки

Свидетельство о регистрации № 2016621672, зарегистрирована в Реестре баз данных 16.12.2016