База данных «База данных компонентов сигнального пути Hedgehog человека (HumHHpathdb)»

Разработчик

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Бухарина Т.А., Фурман Д.П., Лашин С.А., Иванов Р.А.

Краткая характеристика

База данных (БД) структурирует информацию о компонентах сигнального пути Hedgehog (HH Signal pathway) человека. Для ее создания использовалась информация из баз KEGG, NCBI GENE Base, Uniprot, TRRUST, веб-ресурса DAVID. Поиск ассоциаций с патологическими состояниями и построение генной сети выполнялись с помощью системы ANDSystem. БД содержит сведения о генах и кодируемых ими белках, входящими в состав Hedgehog сигнального пути человека, описывает ассоциативные генные сети и выявленные регуляторные контуры, предоставляет термины Онтологии генов, а также включает списки патологических состояний, ассоциированных с каждым из генов. Дополнительно представлены эволюционные характеристики генов — индекс филостратиграфического возраста (PAI) и индекс эволюционной изменчивости (DI).

Области возможного использования

База данных может быть использована:

  • при создании математических моделей различных режимов функционирования Hedgehog сигнального пути;
  • при разработке более эффективных подходов персонализированной медицины на всех этапах, включая диагностику (выявление генов, несущих повреждающие мутации), выбор средств фармакологического воздействия, а также профилактику (генотипирование с целью оценки риска патологии);
  • в процессе обучения студентов различных направлений подготовки (биологических и смежных направлений подготовки), обучающихся по программам бакалавриата, магистратуры и аспирантуры.

Степень готовности разработки к практическому применению

База данных готова к практическому применению. Доступ к данным возможен по запросу.

Возможный технический и (или) экономический эффект

База данных представляет собой универсальный исследовательский инструмент, обеспечивающий быстрый доступ к формализованным и систематизированным данным о Hedgehog сигнальном пути у человека: о генах, белках, имеющихся между ними регуляторных связях, а также об эволюционных характеристиках рассматриваемых генов (относительном эволюционном возрасте и генетической изменчивости). База данных имеет прикладную значимость при разработке более эффективных подходов персонализированной медицины на всех этапах, включая диагностику (выявление генов, несущих повреждающие мутации), выявления мишеней для лекарственной терапии, а также оценку риска возникновения патологических состояний), сокращая затраты на поиск и обработку данных.

Сравнительные характеристики с известными разработками

База данных уникальна и не имеет аналогов. Она объединяет информацию о функционирующих в сигнальном пути генах, белках, регуляторных связях, заболеваниях, связанных с этими генами, а также предоставляет данные об эволюционном возрасте и генетической изменчивости генов.

Защита разработки

Свидетельство о регистрации № 2026620786, зарегистрирована в Реестре баз данных 24.02.2026, Бюл. № 3, Номер и дата поступления заявки: 2026620501      16.02.2026.