Разработчик
ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН
Авторы
Бухарина Т.А., Фурман Д.П., Лашин С.А., Иванов Р.А.
Краткая характеристика
База данных (БД) структурирует информацию о компонентах сигнального пути Hedgehog (HH Signal pathway) человека. Для ее создания использовалась информация из баз KEGG, NCBI GENE Base, Uniprot, TRRUST, веб-ресурса DAVID. Поиск ассоциаций с патологическими состояниями и построение генной сети выполнялись с помощью системы ANDSystem. БД содержит сведения о генах и кодируемых ими белках, входящими в состав Hedgehog сигнального пути человека, описывает ассоциативные генные сети и выявленные регуляторные контуры, предоставляет термины Онтологии генов, а также включает списки патологических состояний, ассоциированных с каждым из генов. Дополнительно представлены эволюционные характеристики генов — индекс филостратиграфического возраста (PAI) и индекс эволюционной изменчивости (DI).
Области возможного использования
База данных может быть использована:
- при создании математических моделей различных режимов функционирования Hedgehog сигнального пути;
- при разработке более эффективных подходов персонализированной медицины на всех этапах, включая диагностику (выявление генов, несущих повреждающие мутации), выбор средств фармакологического воздействия, а также профилактику (генотипирование с целью оценки риска патологии);
- в процессе обучения студентов различных направлений подготовки (биологических и смежных направлений подготовки), обучающихся по программам бакалавриата, магистратуры и аспирантуры.
Степень готовности разработки к практическому применению
База данных готова к практическому применению. Доступ к данным возможен по запросу.
Возможный технический и (или) экономический эффект
База данных представляет собой универсальный исследовательский инструмент, обеспечивающий быстрый доступ к формализованным и систематизированным данным о Hedgehog сигнальном пути у человека: о генах, белках, имеющихся между ними регуляторных связях, а также об эволюционных характеристиках рассматриваемых генов (относительном эволюционном возрасте и генетической изменчивости). База данных имеет прикладную значимость при разработке более эффективных подходов персонализированной медицины на всех этапах, включая диагностику (выявление генов, несущих повреждающие мутации), выявления мишеней для лекарственной терапии, а также оценку риска возникновения патологических состояний), сокращая затраты на поиск и обработку данных.
Сравнительные характеристики с известными разработками
База данных уникальна и не имеет аналогов. Она объединяет информацию о функционирующих в сигнальном пути генах, белках, регуляторных связях, заболеваниях, связанных с этими генами, а также предоставляет данные об эволюционном возрасте и генетической изменчивости генов.
Защита разработки
Свидетельство о регистрации № 2026620786, зарегистрирована в Реестре баз данных 24.02.2026, Бюл. № 3, Номер и дата поступления заявки: 2026620501 16.02.2026.