Разработчик

ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН

Авторы

Аульченко Ю.С., Шашкова Т.И., Цепилов Я.А., Кириченко А.В., Злобин А.С.

Краткая характеристика

База данных (БД) содержит информацию об ассоциациях однонуклеотидных полиморфизмов с различными экономически-важными признаками овец. БД содержит результаты полногеномных исследований ассоциаций и мета-информацию об исследовании, в ходе которого они были получены. База данных может быть использована для проведения маркер-ориентированной и геномной селекции различных пород овец..

Области возможного использования

База данных может быть использована для применения как для изучения генетического контроля широкого круга экономически-важных признаков овец, так и для непосредственно для маркер-ориентированной или геномной селекции. База данных может быть полезна для научных работников, селекционеров, преподавателей и студентов высших учебных заведений.

Степень готовности разработки к практическому применению

База данных готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

База данных «ГАПО» позволяет оперативно находить информацию о маркерах, их эффектах, а также генах широкого круга экономически-важных признаков различных пород овец. Данная информация может быть непосредственно использована в маркер-ориентированной селекции, а также способствовать развитию геномной селекции у овец.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Ближайший аналог база данных “Sheep QTLdb” содержит в себе информацию лишь об значимо ассоциированных локусах количественных признаков, в то время как «ГАПО» предоставляет информацию о всех часто исследуемых локусах (более 400000 маркеров, равномерно распределенных по геному). Стоит отметить, что существует российская разработанная база данных «ГМРиПо», связанная с признаками мясной продуктивности у овец. Однако, по сравнению с «ГМРиПО» база данных «ГАПО» отличается другим набором исследуемых экономически-важных признаков, и спецификой маркеров, представленных в базе. Также «ГАПО» в отличии от «ГМРиПо» содержит в себе информацию о широком круге зарубежных пород.

Защита разработки

Свидетельство о регистрации № 2021620564, зарегистрирована в Реестре баз данных 24.03.2021.