Патентообладатель

ФГБУН ИЦиГ СО РАН

Авторы

Лашин С.А., Кочетов А.В., Афонников Д. А., Зураев Б.С., Клименко А.И.

Краткая характеристика

Программа рассчитывает и выдает пользователю найденные открытые рамки считывания и аминокислотные последовательности (с указанием эффективности трансляции и используемого механизма) для заданной мРНК. Программа доступна в виде веб-приложения, а также отдельного java-приложения.

Области возможного использования

Программа «AUGWeb» может быть использована при проведении высокотехнологичных исследований в области геномики и протеомики, цель программы – выявление «скрытого» кодирующего потенциала уже известных эукариотических мРНК.

Степень готовности разработки к практическому применению

Программа «AUGWeb» готова к практическому применению

Возможный технический и (или) экономический эффект

Использование программы позволит расширить возможности планирования экспериментов с генами эукариот и выявлять новые биологически активные белки и пептиды.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Программа «AUGWeb» является единственной, известной авторам на сегодняшний день, программой предсказания потенциальных открытых рамок считывания, использующих следующие модели трансляции: линейного сканирования, реинициации трансляции и «подтекающего» сканирования (leaky scanning).

Патентная защита разработки

Свидетельство о регистрации № 2015662839 от 04.12.2015.