Патентообладатель: ФГБНУ «ФИЦ ИЦиГ СО РАН»

Авторы: Брагин А.О., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Богомолов А.Г., Кожемякина Р.В., Маркель А.Л., Орлов Ю.Л.

Краткая характеристика:

База данных «ГК-АСАП» является компьютерной технологией в области системной биологии животных. База данных представляет варианты дифференциального альтернативного сплайсинга генов крыс, селекционированных на агрессивное поведение, полученных по данным экспериментов транскриптомного секвенирования. База данных разработана для экспериментаторов-селекционеров и исследователей, которые заинтересованы в получении информации о генах лабораторных животных – серых крыс и их взаимосвязи с поведением. Представлены варианты изоформ генов с различной экспрессией у крыс с агрессивным и толерантным поведением по отношению к человеку. База данных имеет графический web-интерфейс, который предоставляет пользователям возможность проводить поиск интересующих образцов, планировать эксперименты и обеспечивает хранение данных о различных экспериментах и образцах генов, оптимизируя научно-исследовательский процесс в области молекулярно-биологических и генетических исследований лабораторных животных. База данных содержит информацию о транскрипте, об уровнях экспрессии данного транскрипта и значимости различий у агрессивных и неагрессивных крыс. Структура базы позволяет пополнять ее данными других транскриптомных экспериментов по изучению агрессии у крыс.

Области возможного использования:

База данных разработана для экспериментаторов-селекционеров и исследователей, которые заинтересованы в получении информации о генах лабораторных животных – серых крыс и их взаимосвязи с поведением.

Степень готовности разработки к практическому применению:

База данных «ГК-АСАП» готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Возможен технический эффект применения полученных данных для оптимального планирования нейробиологических  экспериментов на модельных животных – крысах, оптимизации экспериментов по анализу экспрессии генов в мозге животных (поиск генов-кандидатов, связанных с поведением).

Сравнительные характеристики с известными разработками

База данных содержит уникальные данные об экспрессии и изоформ и дифференциальном альтернативном сплайсинге генов крыс, селектированных по агрессивному поведению, предоставляя комплементарную информацию к базе «Медведева И.В., Брагин А.О., Чадаева И.В., Маркель А.Л., Орлов Ю.Л. База данных генов, ассоциированных с агрессивным поведением (Маджин) / Database of genes associated with aggressive behavior (Maggene) Свидетельство о государственной регистрации базы данных №2016621672 от 16.12.2016г».

Патентная защита разработки: Свидетельство о госрегистрации № 2018621208, зарег. 07.08.2018.