Патентообладатель: ФГБНУ «ФИЦ ИЦиГ СО РАН»

Авторы: Алемасов Н.А., Иванисенко Н.В.,  Иванисенко В.А.

Краткая характеристика:

Программа предназначена для получения конформационных характеристик белков и их мутантных форм с использованием крупнозернистого моделирования с помощью эластичных сетевых моделей. Рассчитанные конформационные характеристики включают в себя стабильность водородных связей, формирующихся в ходе моделирования, которая рассчитывается, как отношение количества конформаций, в которых связь присутствовала, к общему числу конформаций, полученных в ходе моделирования.

Области возможного использования:

Программа может быть использована для построения моделей машинного обучения при изучении взаимосвязи структура-функция белков. В частности, программа может быть применена для изучения влияния мутаций в белке на крупномасштабные изменения в структуре и динамике этого белка, а также на степень фенотипического проявления исследуемых мутаций.

Степень готовности разработки к практическому применению:

Программа готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Компьютерная программа может применяться для сопровождения экспериментов по изучению связи структура-функция белков, и, в частности, при оптимизации ферментов в ходе разработок в области биотехнологии.

Сравнительные характеристики с известными разработками

Ключевым преимуществом программного средства является расчёт конформационных характеристик мутантных и нативных белков, опирающийся на моделирование крупномасштабных флуктуаций структуры. В ходе верификации программы обнаружилось, что стабильность водородных связей, рассчитываемая на основе ансамбля конформаций, полученного из эластичного сетевого моделирования, позволяет строить более точные модели машинного обучения

Патентная защита разработки: Свидетельство о госрегистрации № 2020662324, зарег. 02.10.2020.