Программа для оценки количественных характеристик колоса пшеницы (ОКХК/WERecognizer)

Разработчик: ФГБНУ «ФИЦ ИЦиГ СО РАН»

Авторы: Комышев Е.Г., Генаев М.А., Афонников Д.А.

Краткая характеристика:

Программа предназначена для решения задач в области компьютерной феномики растений: получения и анализа больших омиксных данных по фенотипическим параметрам колосьев пшеницы. Программа на основе обработки и анализа двумерных цифровых изображений колоса пшеницы позволяет оценить его количественные характеристики: остистость, площадь колоса на изображении, длину, ширину, округлость, вытянутость и другие параметры, характеризующие его форму. Программа может быть использована в области генетики растений для массовой высокопроизводительной обработки феномных данных (компьютерного анализа характеристик формы колоса пшеницы) и последующего использования этих данных вместе с омиксными данными по геномам и транскриптомам пшеницы для изучения взаимосвязи фенотип-генотип.

Области возможного использования:

Программа «ОКХК/WERecognizer» может быть использована в задачах изучения взаимосвязи между генотипом растений и признаками формы и размеров колоса у пшеницы, для задач классификации растений и оценки их продуктивности.

Степень готовности разработки к практическому применению:

Программа «ОКХК/WERecognizer» готова к практическому применению.

Возможный технический и (или) экономический эффект

Использование программы позволит значительно ускорить и упростить процедуру получения и обработки больших омиксных данных в области фенотипирования растений.

Сравнительные характеристики с известными разработками

По сравнению с существующими программами «ОКХК/WERecognizer» имеет возможности определения большего числа морфометрических параметров колосьев.

Защита разработки: Свидетельство о госрегистрации №2019666362, зарегистрирована в Реестре программ для ЭВМ 09.12.2019.